《Omicron突變存在已久——複試系列》

日本政府最近宣布，如果檢測到 Omicron 菌株，將被視為“富人”接觸者（只需在同一航班上並富人？？），並將在指定的設施中進行隔離。

昨天我告訴過你，我想知道如何檢測 Omicron 菌株（peplomer 區域基因的多個突變）。

為了進行基因分析，首先需要使用與 PCR 相同的原理擴增刺突蛋白的基因區域。

有報導稱，雖然此時使用的被稱為引物的基因序列（寡聚體）從一開始就有所改進，但仍有可能無法檢測到像Omicron（“大片暗-”物質）這樣的突變體（未測序）在 GISAID 中大量樣本的 SARS-Cov2 刺突蛋白中——可能是由於 ARTIC 引物偽影——這將掩蓋這些基因組區域中的真正突變，以及某些突變出現的位置/時間。”10.31219/ osf.io/hukgm)（ARTIC 版本 3 和版本 4 SARS-CoV-2 引物的分析及其對刺突蛋白中 G142D 氨基酸取代檢測的影響。BioRxiv 預印本 doi：https://doi.org / 10.101 / 2021.09.27.461949）。

遺傳分析還表明，存在無法捕獲的基因區域（產生刺突蛋白的基因序列）。

即使通過基因分析也無法準確檢測到它的事實變得顯著，尤其是當病毒量低（低擴增子）時（使用納米孔對 SARS-CoV-2 基因組測序的 ARTIC 多重 PCR 方法的改進。版本 1. bioRxiv。預印本。2020 年 9 月 4.doi：10.1101 / 2020.09.04.283077）（ARTIC Network 多重 PCR 替代引物的提議，以提高 SARS-CoV-2 基因組測序的覆蓋率。BioRxiv [Internet]. Biorxiv.org; 2020; Available來自：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.985150v2.abstract）。

換句話說，基因分析是一種發展中的測試方法，仍有改進的空間。

因此，即使在Omicron的懷疑下進行基因分析，也只能確認基因序列並未完全闡明。

截至2020年9月，數據庫（GISAID）中已有超過9萬個新冠病毒基因序列。

現在應該報告更多類型的新型冠狀病毒。

據推測，目前 Omicron 製造噪音的原因是現在可以檢測到以前無法通過基因分析檢測到的突變類型。

這是因為南非不太可能在短時間內迅速擴展到全世界。

對了，南非首例發現Omicron突變的病例是2021年6月17日從數據庫中發現的（目前該信息已從數據庫中刪除）。

據說傳染性極強的Omicron，會不會等五個月，傳遍全世界？

5 個月後，Omicron 的原始變體將已經有數百個變體。

正如我們一開始所說的，新冠大流行是PCR大流行，Omicron等突變騷動也是基因分析大流行的不准確所帶來的節日騷動（使用不准確），未來會揭曉（^_ −) − ☆。