《Omicron突变存在已久——复试系列》

日本政府最近宣布，如果检测到 Omicron 菌株，将被视为“富人”接触者（只需在同一航班上并富人？？），并将在指定的设施中进行隔离。

昨天我告诉过你，我想知道如何检测 Omicron 菌株（peplomer 区域基因的多个突变）。

为了进行基因分析，首先需要使用与 PCR 相同的原理扩增刺突蛋白的基因区域。

有报道称，虽然此时使用的被称为引物的基因序列（寡聚体）从一开始就有所改进，但仍有可能无法检测到像Omicron（“大片暗-”物质）这样的突变体（未测序）在 GISAID 中大量样本的 SARS-Cov2 刺突蛋白中——可能是由于 ARTIC 引物伪影——这将掩​​盖这些基因组区域中的真正突变，以及某些突变出现的位置/时间。”10.31219/ osf.io/hukgm)（ARTIC 版本 3 和版本 4 SARS-CoV-2 引物的分析及其对刺突蛋白中 G142D 氨基酸取代检测的影响。BioRxiv 预印本 doi：https://doi.org / 10.101 / 2021.09.27.461949）。

遗传分析还表明，存在无法捕获的基因区域（产生刺突蛋白的基因序列）。

即使通过基因分析也无法准确检测到它的事实变得显着，尤其是当病毒量低（低扩增子）时（使用纳米孔对 SARS-CoV-2 基因组测序的 ARTIC 多重 PCR 方法的改进。版本 1. bioRxiv。预印本。2020 年 9 月 4.doi: 10.1101 / 2020.09.04.283077）（ARTIC Network 多重 PCR 替代引物的提议，以提高 SARS-CoV-2 基因组测序的覆盖率。BioRxiv [Internet]. Biorxiv.org; 2020; Available来自：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.985150v2.abstract）。

换句话说，基因分析是一种发展中的测试方法，仍有改进的空间。

因此，即使在Omicron的怀疑下进行基因分析，也只能确认基因序列并未完全阐明。

截至2020年9月，数据库（GISAID）中已有超过9万个新冠病毒基因序列。

现在应该报告更多类型的新型冠状病毒。

据推测，目前 Omicron 制造噪音的原因是现在可以检测到以前无法通过基因分析检测到的突变类型。

这是因为南非不太可能在短时间内迅速扩展到全世界。

对了，南非首例发现Omicron突变的病例是2021年6月17日从数据库中发现的（目前该信息已从数据库中删除）。

据说传染性极强的Omicron，会不会等五个月，传遍全世界？

5 个月后，Omicron 的原始变体将已经有数百个变体。

正如我们一开始所说的，新冠大流行是PCR大流行，Omicron等突变骚动也是基因分析大流行的不准确所带来的节日骚动（使用不准确），未来会揭晓（^_ −) − ☆。